MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28

Total Repeats: 387

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008568	TGA	2	6	94	99	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008568	T	6	6	101	106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008568	A	6	6	131	136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008568	TAA	2	6	137	142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008568	AAT	2	6	143	148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008568	A	6	6	155	160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008568	T	7	7	241	247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008568	T	6	6	284	289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008568	GAT	2	6	303	308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008568	T	6	6	312	317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008568	ACT	2	6	325	330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008568	TA	3	6	546	551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008568	ATT	2	6	552	557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008568	T	7	7	574	580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008568	ATT	2	6	582	587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008568	T	6	6	651	656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008568	A	7	7	666	672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008568	TAT	2	6	933	938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008568	TTTA	2	8	949	956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008568	CA	3	6	968	973	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008568	AACT	2	8	974	981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008568	TAA	2	6	984	989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008568	TCT	2	6	1066	1071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008568	AT	3	6	1087	1092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008568	TAA	2	6	1115	1120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008568	TAC	2	6	1150	1155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008568	AAT	2	6	1194	1199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008568	A	6	6	1230	1235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008568	ATT	2	6	1258	1263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008568	ATC	2	6	1326	1331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008568	A	6	6	1332	1337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008568	TCAAAA	2	12	1343	1354	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_008568	TAA	2	6	1368	1373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008568	ATA	2	6	1374	1379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008568	A	6	6	1390	1395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008568	ATTAT	2	10	2417	2426	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008568	ATTA	2	8	2434	2441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008568	ATTA	2	8	2455	2462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008568	ATTA	2	8	2476	2483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008568	ATTA	2	8	2497	2504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008568	ATTA	2	8	2518	2525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008568	AT	3	6	2535	2540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008568	AT	3	6	2556	2561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008568	AT	3	6	2577	2582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008568	AT	3	6	2598	2603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008568	AT	3	6	2619	2624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008568	AT	3	6	2640	2645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008568	AT	3	6	2661	2666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008568	AT	3	6	2682	2687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008568	AT	3	6	2703	2708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008568	AT	3	6	2724	2729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008568	AT	3	6	2745	2750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008568	TAG	2	6	2774	2779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008568	ATTAA	2	10	2782	2791	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008568	TAAT	2	8	2795	2802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008568	CTA	2	6	2810	2815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008568	AGT	3	9	2879	2887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008568	CTTAT	2	10	2947	2956	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_008568	TTA	2	6	3004	3009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008568	TAT	2	6	3022	3027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008568	ACA	2	6	3036	3041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008568	A	7	7	3045	3051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008568	CTT	2	6	3058	3063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008568	TAT	2	6	3110	3115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008568	ACAA	2	8	3130	3137	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008568	ACT	2	6	3162	3167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008568	CAA	2	6	3233	3238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008568	AAT	2	6	3240	3245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008568	CTA	2	6	3249	3254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008568	T	6	6	3298	3303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008568	TA	3	6	3309	3314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008568	ATTT	2	8	3339	3346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008568	TAT	2	6	3350	3355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008568	CTAC	2	8	3456	3463	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008568	TA	3	6	3496	3501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008568	TTA	3	9	3512	3520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008568	ATC	2	6	3533	3538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008568	CAA	2	6	3548	3553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008568	T	6	6	3595	3600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008568	AGT	2	6	3629	3634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008568	TCTTT	2	10	3655	3664	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_008568	T	7	7	3673	3679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008568	TAA	2	6	3718	3723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008568	TAT	2	6	3738	3743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008568	TAC	2	6	3840	3845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008568	A	6	6	3902	3907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008568	TTA	2	6	3908	3913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008568	CTT	2	6	3985	3990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008568	TGAA	2	8	4001	4008	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008568	T	9	9	4043	4051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008568	AT	3	6	4065	4070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008568	TTA	2	6	4089	4094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008568	TAT	2	6	4109	4114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008568	CA	3	6	4146	4151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008568	AACT	2	8	4152	4159	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008568	TAA	2	6	4162	4167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008568	ATTA	2	8	4186	4193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008568	TCT	2	6	4249	4254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008568	AT	3	6	4272	4277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008568	TAC	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008568	AAT	2	6	4379	4384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008568	A	6	6	4415	4420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008568	ATT	2	6	4443	4448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008568	A	6	6	4477	4482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008568	ATT	2	6	4505	4510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008568	A	6	6	4539	4544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008568	ATT	2	6	4567	4572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008568	ATT	2	6	4579	4584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008568	C	6	6	4614	4619	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_008568	TATT	2	8	4675	4682	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008568	T	6	6	4684	4689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008568	TTTC	2	8	4717	4724	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008568	ACA	2	6	4773	4778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008568	A	8	8	4785	4792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008568	T	7	7	4807	4813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008568	AT	3	6	4835	4840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008568	ATTAT	2	10	4856	4865	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008568	AT	3	6	4872	4877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008568	TAA	2	6	4884	4889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008568	T	6	6	4894	4899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008568	TTAAA	2	10	5574	5583	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008568	TATTT	2	10	5590	5599	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008568	ATT	3	9	5600	5608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008568	ATA	2	6	5611	5616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008568	A	7	7	5628	5634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008568	TA	3	6	5643	5648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008568	CTT	2	6	5727	5732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008568	T	8	8	5731	5738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008568	A	8	8	5788	5795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008568	AATT	2	8	5826	5833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008568	TAA	2	6	5864	5869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008568	GAT	2	6	5870	5875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008568	AAT	2	6	5885	5890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008568	A	7	7	5896	5902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008568	AATA	2	8	5927	5934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008568	AAT	2	6	5948	5953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008568	ATT	2	6	5976	5981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008568	A	8	8	5986	5993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008568	A	6	6	5997	6002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008568	ATT	2	6	6019	6024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008568	TAA	2	6	6029	6034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008568	T	6	6	6055	6060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008568	TAT	2	6	6076	6081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008568	CATAC	2	10	6094	6103	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_008568	TAAA	2	8	6111	6118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008568	TA	3	6	6146	6151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008568	ATTA	2	8	6158	6165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008568	ATTT	2	8	6166	6173	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008568	AAT	2	6	6226	6231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008568	TA	3	6	6301	6306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008568	T	6	6	6313	6318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008568	ATT	2	6	6360	6365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008568	ATA	2	6	6381	6386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008568	TA	3	6	6390	6395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_008568	TAA	2	6	7083	7088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008568	A	8	8	7087	7094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008568	ATT	2	6	7122	7127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.